Química combinatoria para el descubrimiento de nuevos compuestos
Fernando Albericio
Investigador Principal
Professor (Organic Chemistry Dept. - UB)
Tel Oficina : +34 93 403 70 88
Tel Lab : +34 93 4037087-+34 93 4037069
correo-e : fernando.albericio
irbbarcelona.org
Introducción
Este grupo utiliza diferentes herramientas de la ciencia para la obtención de dos nuevos tipos de compuestos: agentes farmacológicos (química terapéutica) y polímeros (nuevos materiales). Nuestra investigación implica dos elementos complementarios: la explotación de nuevos métodos para la preparación de quimiotecas y la aplicación de estos métodos en la búsqueda de nuevos compuestos. En términos metodológicos, trabajamos sobre soportes, espaciadores, esqueletos y estructuras privilegiadas que interaccionan con dos o más receptores que no están relacionados entre ellos. En el campo de la química terapéutica, nuestros estudios se centran principalmente en dos tipos de procesos: el cáncer y los desórdenes del sistema nervioso central.
Líneas de Investigación
a) Síntesis y asignación estructural de péptidos con bioactividad
Péptidos marinos. En este subproyecto, nos centramos en compuestos estructuralmente diferentes: kahalalide F (actualmente en ensayos clínicos de fase III), ciclopéptidos y péptidos con azoles concatenados. Nuestros intereses principales son: realizar análogos de los compuestos naturales para aumentar la potencia de compuestos naturales como lo es el kahalalide F; la preparación de quimiotecas análogas para mejorar las propiedades de ADME (absorción, distribución, metabolismo y excreción); el desarrollo de metodologías sintéticas para estos compuestos.
Vacunas peptídicas contra el cáncer: este proyecto dirige el desarrollo racional de las vacunes sintéticas con base de péptidos en el tratamiento contra el melanoma. Con el fin de eliminar tumores y prevenir la expansión a otros órganos (metástasis), la vacuna contra el cáncer tiene que ser capaz de estimular selectivamente tanto la respuesta inmunológica celular (linfocitos T citotóxicos) como humoral (linfocitos B específicos). La flexibilidad estructural de las vacunas de péptidos propuestas facilitaría el desarrollo de estrategias terapéuticas específicas tanto para el cáncer como para los pacientes. Además, una misma vacuna podría incluir diversos antígenos, de tal manera que se aumentaría la eficacia y se podría prevenir la aparición de variantes resistentes.
b) Síntesis de sistemas poliheterocíclicos de nitrógeno
Los invertebrados marinos, como las esponjas, los tunicados, los ascídidos y los corales, nos han dado una buena reserva de nuevos compuestos bioactivos. Estos compuestos tienen una estructura característica sin precedentes, y son muy activos contra diversos tipos de células tumorales. Hemos sintetizado una gran cantidad de alcaloides marinos (ver lista más abajo) en solución o en fase sólida y, actualmente, estamos preparando una quimioteca de compuestos que están relacionados, de la misma manera que desarrollan síntesis totales de alcaloides marinos nuevos. Por ejemplo: ascididemina, variolina B, pirroles derivados de lamellarina, lamellarinas pentacíclicas.
c) Síntesis en fase sólida de quimiotecas de compuestos bioactivos
Por medio de la química combinatoria preparamos quimiotecas de tamaño mediano con la intención de mejorar la actividad, las propiedades físicas y otras características de los compuestos bioactivos.
d) Nuevas resinas y nuevos espaciadores
La síntesis en fase sólida exige resinas y espaciadores que estén adecuadamente funcionarizados. Las resinas, además de servir de apoyo de anclaje material del esqueleto y de ayuda para el crecimiento del compuesto, también tienen que servir de grupo de protección de la funcionalidad del material reactivo de partida. Nuestra investigación en este campo incluye la modificación de resinas comercializadas y la síntesis de nuevos espaciadores.
e) La química de hexafluoroacetona (HFA)
La aplicación bifuncional de la HFA como grupo de protección y agente activador de los hidroxiácidos A es útil para la preparación de depsipéptidos y de otros compuestos de interés biológico. Actualmente estamos preparando análogos depsipéptidos de la cilengitida (Merck) aisí como quimiotecas de péptidos y de compuestos glicosídicos.
Financiación
Este grupo recibe financiación de las instituciones siguientes:
- Comisión Interministerial de Ciencia y Tecnología
- Fundació La Marató de TV3
- Secretaría de Estado de Cooperación Internacional (AECI)
Más información
Química combinatoria para el descubrimiento de nuevos compuestos
Solid-phase combinatorial synthesis of a lysyl-tRNA synthetase (LysRS) inhibitory library
Farrera-Sinfreu J, Español Y, Geslain R, Guitart T, Albericio F, Ribas de Pouplana L and Royo M
J Comb Chem, 10 (3), 391-400 (2008)
Synthesis of oligonucleotide derivatives using ChemMatrix supports
Mazzini S, García-Martin F, Alvira M, Aviñó A, Manning B, Albericio F and Eritja R
Chem Biodivers, 5 (1), 209-218 (2008)
Solid-phase synthesis of oligomers carrying several chromophore units linked by phosphodiester backbones
Aviñó A, Navarro I, Farrera-Sinfreu J, Royo M, Aymamí J, Delgado A, Llebaria A, Albericio F and Eritja R
Bioorg Med Chem Lett, 18 (7), 2306-2310 (2008)
Design, synthesis and antiproliferative properties of oligomers with chromophore units linked by amide backbones
Farrera-Sinfreu J, Aviñó A, Navarro I, Aymamí J, Beteta NG, Varón S, Pérez-Tomás R, Castillo-Avila W, Eritja R, Albericio F and Royo M
Bioorg Med Chem Lett, 18 (7), 2440-2444 (2008)
A nonacid degradable linker for solid-phase synthesis
Colombo A, De la Figuera N, Fernàndez JC, Fernández-Forner D, Albericio F and Forns P
Org Lett, 9 (21), 4319-4322 (2007)
Novel proton acceptor immonium-type coupling reagents: application in solution and solid-phase peptide synthesis
Ayman El-Faham and Fernando Albericio
Org Lett, 9 (22), 4475-4477 (2007)
Simple machine-assisted protocol for solid-phase synthesis of depsipeptides
Spengler J, Koksch B and Albericio F
Biopolymers, 88 (6), 823-828 (2007)
Design and synthesis of indole-based peptoids as potent noncompetitive antagonists of transient receptor potential vanilloid 1
Quintanar-Audelo M, Fernández-Carvajal A, Van Den Nest W, Carreño C, Ferrer-Montiel A and Albericio F
J Med Chem, 50 (24), 6133-6143 (2007)
The synthesis of naturally occurring peptides and their analogs
Cupido T, Tulla-Puche J, Spengler J and Albericio F
Curr Opin Drug Discov Devel, 10 (6), 768-783 (2007)
Enolase as a plasminogen binding protein in Leishmania mexicana
Vanegas G, Quiñones W, Carrasco-López C, Concepción JL and Albericio F and Avilán L
Parasitol Res, 101 (6), 1511-1516 (2007)
Formation of dihydrouracils via cyclization of N-Substituted 3-Thioureidopropanoic acids and facile desulfurization
Carina ML, Delpiccolo, Albericio F, Schiksnis R A and Michelotti EL
Tetrahedron, 63, 8949-8953 (2007)
Identification of protein-binding peptides by direct MALDI-TOF-MS analysis of peptide beads selected from the screening of one-bead-one peptide combinatorial libraries
Marani MM, Oliveira E, Côte S, Camperi SA, Albericio F and Cascone O
Anal Biochem, 370 (2), 215-222 (2007)
Solid-phase synthesis of oxathiocoraline by a key intermolecular disulfide dimer
Tulla-Puche J, Bayó-Puxan N, Moreno JA, Francesch AM, Cuevas C, Álvarez M and Albericio F
J Am Chem Soc, 129 (17), 5322-5323 (2007)
Smallest peptoids with antiproliferative activity on human neoplastic cells
Mas-Moruno C, Cruz LJ, Mora P, Messeguer A, Pérez-Payá E and Albericio F
J Med Chem, 50 (10), 2443-2449 (2007)
Solid-phase synthesis of sulfamate peptidomimetics
Farrera-Sinfreu J, Albericio F and Royo M
J Comb Chem, 9 (3), 501-506 (2007)
From the one-bead-one-compound concept to one-bead-one-reactor
Marani MM, Paradís-Bas M, Tulla-Puche J, Côté S, Camperi SA, Cascone O and Albericio F
J Comb Chem, 9 (3), 395-398 (2007)
Cell-penetrating proline-rich peptidomimetics
Farrera-Sinfreu J, Giralt E, Royo M and Albericio F
Methods Mol Biol, 386, 241-267 (2007)
Synthesis of IB-01211, a cyclic peptide containing 2,4-concatenated thia- and oxazoles, via Hantzsch macrocyclization
Hernández D, Vilar G, Riego E, Cañedo LM, Cuevas C, Albericio F and Alvarez M
Org Lett, 9 (5), 809-811 (2007)
Understanding the mechanism of action of the novel SSAO substrate (C7NH10)6(V10O28).2H2O, a prodrug of peroxovanadate insulin mimetics
Yraola F, García-Vicente S, Marti L, Albericio F, Zorzano A and Royo M
Chem Biol Drug Des, 69 (6), 423-428 (2007)
Novel ergopeptides as dual ligands for adenosine and dopamine receptors
Vendrell M, Angulo E, Casado V, Lluis C, Franco R, Albericio F and Royo M
J Med Chem, 50 (13), 3062-3069 (2007)
Peptides and metallic nanoparticles for biomedical applications
Kogan MJ, Olmedo I, Hosta L, Guerrero AR, Cruz LJ and Albericio F
Nanomed, 2 (3), 287-306 (2007)
Beyond azathicoraline synthesis. Synthesis of analogues
Bayó-Puxan N, Fernández A, Tulla-Puche J, Riego E, Álvarez M and Albericio F
Int J Pept Res Ther, 13 (1-2), 205-306 (2007)
Synthesis and structure-activity relationship of cytotoxic marine cyclodepsipeptide IB-01212 analogues
Cruz LJ, Francesch A, Cuevas C and Albericio F
ChemMedChem, 2 (7), 1076-1084 (2007)
ds-Oligonucleotide-peptide conjugates featuring peptides from the leucine-zipper region of Fos as switchable receptors for the oncoprotein Jun
Portela C, Albericio F, Eritja R, Castedo L and Mascareñas JL
ChemBiochem, 8 (10), 1110-1114 (2007)
Advances in solid-phase cycloadditions for heterocyclic synthesis
Feliu L, Vera-Luque P, Albericio F and Alvarez M
J Comb Chem, 9 (4), 521-565 (2007)
Oral insulin-mimetic compounds that act independently of insulin
Garcia-Vicente S, Yraola F, Marti L, González-Muñoz E, García-Barrado MJ, Canto C, Abella A, Bour S, Artuch R, Sierra C, Brandi N, Carpene C, Moratinos J, Camps M, Palacín M, Testar X, Guma A, Albericio F, Royo M, Mian A and Zorzano A
Diabetes, 56 (2), 486-493 (2007)
Inhibition of VAP1: quickly gaining ground as an anti-inflammatory therapy
Yraola F, Albericio F and Royo M
ChemMedChem, 2 (2), 173-174 (2007)
p-Nitromandelic acid as a highly acid-stable safety-catch linker for solid-phase synthesis of peptide and depsipeptide acids
Isidro-Llobet A, Alvarez M, Burger K, Spengler J and Albericio F
Org Lett, 9 (8), 1429-1432 (2007)
New developments on the synthesis of oligonucleotide-peptide conjugates
Portela C, Mascareñas JL, Albericio F, Mazzini S, Caminal C, Ramos R, Ocampo SM and Eritja R
Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids, 26 (8-9), 963-967 (2007)
Amide-to-ester substitution in coiled coils: the effect of removing hydrogen bonds on protein structure
Scheike JA, Baldauf C, Spengler J, Albericio F, Pisabarro MT and Koksch B
Angew Chem Int Ed Engl, 46 (41), 7766-7769 (2007)
Efficient regioselective monobromination of highly activated benzenes
Pla D, Albericio F and Álvarez M
Eur J Org Chem, 12, 1921-1924 (2007)
Chlorotrityl chloride (CTC) resin as a convenient reusable protecting group
García MF, Puxan NB , Cruz LJ, Bohling CJ and Albericio F
QSAR & Comb Sci, 26, 1027-1035 (2007)
Preparation of penta-azole containing cyclopeptides: challenges in macrocyclization
Hernández D, Riego E, Francesch A, Cuevas C, Albericio F and Álvarez M
Tetrahedron, 63, 9862-9870 (2007)
Chemical synthesis of 19F-labeled HIV-1 protease using fmoc-chemistry and ChemMatrix Resin
Frutos S, Tulla-Puche J, Albericio F and Giralt E
Int J Pept Res Ther, 13, 221-227 (2007)
Partially fluorinated heterocycles from 4,4-Bis(trifluoromethyl)-hetero-1,3-dienes via C-F bond activation
Burger K, Helmreich B, Henning L, Spengler J, Albericio F and Fuchs A
Monatshefte fuer Chemie/Chemical Monthly, 138, 227-236 (2007)
Novel synthesis of bisaryl acetylenes
Soley R, Albericio F and Álvarez M
Synthesis, 10, 1559-1565 (2007)
Fmoc-2-mercaptobenzothiazole, for the introduction of the Fmoc moiety free of side-reactions
Isidro-Llobet A, Just-Baringo X, Ewenson A, Alvarez M and Albericio F
Biopolymers, 88, 733-737 (2007)
Total solid-phase synthesis of marine cyclodepsipeptide IB-01212
Cruz LJ, Cuevas C, Cañedo LM, Giralt E and Albericio F
J Org Chem, 71 (9), 3339-3344 (2006)
IB-01212, a new cytotoxic cyclodepsipeptide isolated from the marine fungus Clonostachys sp. ESNA-A009
Cruz LJ, Insua MM, Baz JP, Trujillo M, Rodriguez-Mias RA, Oliveira E, Giralt E, Albericio F and Cañedo LM
J Org Chem, 71 (9), 3335-3338 (2006)
A convenient semicarbazide resin for the solid-phase synthesis of peptide ketones and aldehydes
Vázquez J and Albericio F
Tetrahedron Lett, 47 (10), 1657-1661 (2006)
A straightforward synthesis of 5'-peptide oligonucleotide conjugates using N(alpha)-Fmoc-protected amino acids
Ocampo SM, Albericio F, Fernández I, Vilaseca M and Eritja R
Org Lett, 7 (20), 4349-4352 (2005)
Peptide and amide bond-containing dendrimers
Crespo L, Sanclimens G, Pons M, Giralt E, Royo M and Albericio F
Chem Rev, 105 (5), 1663-1681 (2005)
Cell-penetrating cis-gamma-amino-l-proline-derived peptides
Farrera-Sinfreu J, Giralt E, Castel S, Albericio F and Royo M
J Am Chem Soc, 127 (26), 9459-9468 (2005)
Multicomponent reactions with dihydroazines: efficient synthesis of a diverse set of pyrido-fused tetrahydroquinolines
Carranco I, Díaz JL, Jiménez O, Vendrell M, Albericio F, Royo M and Lavilla R
J Comb Chem, 7 (1), 33-41 (2005)
A new strategy for solid-phase depsipeptide synthesis using recoverable building blocks
Albericio F, Burger K, Ruíz-Rodríguez J and Spengler J
Org Lett, 7 (4), 597-600 (2005)
Preparation of de novo globular proteins based on proline dendrimers
Sanclimens G, Crespo L, Giralt E, Albericio F and Royo M
J Org Chem, 70 (16), 6274-6281 (2005)
Solid-phase synthesis of second-generation polyproline dendrimers
Sanclimens G, Crespo L, Giralt E, Royo M and Albericio F
Biopolymers, 76 (4), 283-297 (2004)
Solid-phase combinatorial synthesis of peptide-biphenyl hybrids as calpain inhibitors
Montero A, Albericio F, Royo M and Herradón B
Org Lett, 6 (22), 4089-4092 (2004)
A new class of foldamers based on cis-gamma-amino-L-proline
Farrera-Sinfreu J, Zaccaro L, Vidal D, Salvatella X, Giralt E, Pons M, Albericio F and Royo M
J Am Chem Soc, 126 (19), 6048-6057 (2004)
Developments in peptide and amide synthesis
Albericio F
Curr Opin Chem Biol, 8 (3), 211-221 (2004)
From production of peptides in milligram amounts for research to multi-tons quantities for drugs of the future
Bruckdorfer T, Marder O and Albericio F
Curr Pharm Biotechnol, 5 (1), 29-43 (2004)
Solid-phase syntheses of furopyridine and furoquinoline systems
Cironi P, Tulla-Puche J, Barany G, Albericio F and Alvarez M
Org Lett, 6 (9), 1405-1408 (2004)
Bicyclic homodetic peptide libraries: comparison of synthetic strategies for their solid-phase synthesis
Teixido M, Altamura M, Quartara L, Giolitti A, Maggi CA, Giralt E and Albericio F
J Comb Chem, 5 (6), 760-768 (2003)
Solid-phase synthesis of the cyclic lipononadepsipeptide [N-Mst(Ser1), d-Ser4, L-Thr6, L-Asp8, L-Thr9]syringotoxin
Bayó N, Jiménez JC, Rivas L, Nicolás E and Albericio F
Chemistry, 9 (5), 1096-1103 (2003)
Tentoxin as a scaffold for drug discovery. Total solid-phase synthesis of tentoxin and a library of analogues
Jiménez JC, Chavarría B, López-Macià A, Royo M, Giralt E and Albericio F
Org Lett, 5 (12), 2115-2118 (2003)
Synthesis and SAR of alpha-acylaminoketone ligands for control of gene expression
Tice CM, Hormann RE, Thompson CS, Friz JL, Cavanaugh CK, Michelotti EL, Garcia J, Nicolas E and Albericio F
Bioorg Med Chem Lett, 13 (3), 475-478 (2003)
Saturated resins or stress of the resin
Sanclimens G, Crespo L, Pons M, Giralt E, Albericio F and Royo M
Tetrahedron Letters, 44 (9), 1751-1754 (2003)
Synthesis and NMR structure of p41icf, a potent inhibitor of human cathepsin L
Chiva C, Barthe P, Codina A, Gairí M, Molina F, Granier C, Pugnière M, Inui T, Nishio H, Nishiuchi Y, Kimura T, Sakakibara S, Albericio F and Giralt E
J Am Chem Soc, 125 (6), 1508-1517 (2003)
Solid-phase total synthesis of the pentacyclic system lamellarins U and L
Cironi P, Manzanares I, Albericio F and Alvarez M
Org Lett, 5 (16), 2959-2962 (2003)
Qualitative colorimetric tests for solid phase synthesis
Vázquez J, Qushair G and Albericio F
Methods Enzymol, 369, 21-35 (2003)
Química combinatoria para el descubrimiento de nuevos compuestos
Fernando Albericio
Investigador Principal
Professor (Organic Chemistry Dept. - UB)
Tel Oficina : +34 93 403 70 88
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Managing Director
Mercedes Álvarez
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Postdoctoral Fellow
Jan Spengler
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Judit Tulla
tel +34 93 403 48 69
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Svetlana Savina
tel +34 93 403 78 07
fax +34 93 403 71 26
Miroslav Sisa
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Silvia Cavalli
tel +34 93 403 48 69
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PhD Student
Tommaso Cupido
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Xavier Just Baringo
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Peter Fransen
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Anna-Iris Fernández
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Laia Miret
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laia.miretirbbarcelona.org
Project Manager
Eva Poca
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eva.pocairbbarcelona.org
Research Assistant
Gerardo Alexis Acosta
tel +34 93 403 70 87
gerardo.acostairbbarcelona.org
Marta Paradís
tel +34 93 403 48 69
mparadispcb.ub.es
Miriam Góngora Benitez
tel +34 93 403 48 69
miriam.gongorairbbarcelona.org
Visiting Professor
Sukhendu Dev
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